I projektet SPOTLIGHT vill forskarna utveckla, kombinera och ytterligare förbättra tekniker som används inom molekylärbiologin. Projektet syftar till att utveckla nya omik-metoder och därmed öppna upp nya möjligheter att studera sjukdomar samt påskynda nya upptäckter inom livsvetenskaperna.
Bild av lungvävnad med fluorescensmikroskopi (nedre vänstra hörn) och dess analys av intensitetsförhållanden inuti cellkärnorna (övre högra hörn) (blåa: cellkärnor, grönt: yap protein, röda: at1-celler, gula: at2-celler)
Forskarna bakom projektet förklarar: ”Om vi vill förstå biologiska processer såsom cellkommunikation och immunsvar är det avgörande att studera celler i tre dimensioner (3D). Studier med 2D-mikroskopi, av till exempel cellodlingar eller tunna vävnadssnitt, missar nämligen viktiga interaktioner mellan närliggande celler och begränsar därmed vår förståelse av dessa cellulära processer.
Cellsekvensering är en annan användbar teknik för att studera individuella cellers beteende, men tyvärr förlorar vi den rumsliga (3D) kontexten inom vävnaden, vilket är avgörande för att förstå cell-cell-interaktioner. Spatiala omik-metoder bevarar däremot cellernas rumsliga kontext i vävnaden, vilket ger djupare insikter i deras organisation och funktion. Dock är befintliga spatiala omik-metoder endast utvecklade för tunna (2D) vävnadssnitt.”
I projektet SPOTLIGHT vill forskarna utveckla och ytterligare förbättra de tekniker som finns tillgängliga idag. Projektet syftar till att utveckla nya omik-metoder med hjälp av 3D-avbildningsteknik, såsom ljusskiktsmikroskopi i kombination med multiplex avläsning. Dessa förbättringar kommer att resultera i att vävnadsanalys kan göras snabbare, billigare och vara mer detaljerad. Genom att kombinera dessa olika tekniker försöker forskarna öppna upp nya möjligheter att studera sjukdomar, förbättra både diagnostik och prognostik samt påskynda nya upptäckter inom livsvetenskaperna. LMK Postdok för projektet är Tom Delaire, postdoktor vid Lungbiologi, Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap vid Lunds universitet.